- El Palacio Cantón fue construido entre 1904 y 1911 como residencia familiar del Gral. Francisco Cantón Rosado, propietario de haciendas ganaderas y empresario de ferrocarriles, así como gobernador de Yucatán entre 1898 - 1902. El inmueble perteneció a su familia hasta que en 1932 pasó a ser propiedad del gobierno de Yucatán.
- El proyecto del palacio Cantón estuvo a cargo del arquitecto italiano Enrico Deserti quien también dirigió, en la misma época, la edificación del teatro Peón Contreras. El estilo de la construcción buscaba emular la magnificencia de los palacios galos en Europa. Los detalles del edificio, tanto al exterior como al interior, fueron realizados por el escultor y artista Michele Giacomino.
- La majestuosidad del inmueble resalta por sus dimensiones y los materiales empleados en su construcción; como pastillaje en yeso, mármol en varios tonos, finos acabados en los techos, columnas dóricas y jónicas, una bella escalinata tallada en mármol blanco y jardines exteriores.
- En los años siguientes el inmueble tuvo diferentes usos: fue sede de la Escuela de Bellas Artes, de la Escuela Hidalgo; fue residencia de varios gobernadores de Yucatán, sede de la Biblioteca Crescencio Carrillo y Ancona, de la Academia de la Lengua Maya, del Instituto Yucateco de Antropología e Historia y finalmente de la Escuela de Ciencias Antropológicas de la Universidad de Yucatán.
- En 1980, se convierte en la sede del Museo Regional de Antropología, mejor conocido como Palacio Cantón su exposición permanente acerca de la sociedad maya prehispánica se presenta en la planta principal. A partir del 2012 ha cambiado sus contenidos para presentar exhibiciones temporales, talleres educativos y eventos culturales.
- Actualmente el museo ofrece un programa académico y cultural complementario que lo convierte en un espacio de relevancia en la agenda cultural meridana y es posible realizar servicio social, prácticas profesionales y voluntariado en la institución. También cuenta con una librería independiente Educal que labora en el horario del museo.
